Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NcanP55066 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NcanP55066 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NcanP55066 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NcanP55066 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NcanP55066 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NcanP55066 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NcanP55066 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NcanP55066 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NcanP55066 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NcanP55066 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NcanP55066 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NcanP55066 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NcanP55066 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NcanP55066 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NcanP55066 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NcanP55066 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NcanP55066 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NcanP55066 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NcanP55066 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NcanP55066 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NcanP55066 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NcanP55066 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NcanP55066 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NcanP55066 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NcanP55066 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NcanP55066 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NcanP55066 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NcanP55066 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NcanP55066 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NcanP55066 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NcanP55066 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NcanP55066 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NcanP55066 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NcanP55066 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NcanP55066 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NcanP55066 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NcanP55066 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NcanP55066 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NcanP55066 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NcanP55066 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NcanP55066 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NcanP55066 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NcanP55066 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NcanP55066 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NcanP55066 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NcanP55066 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NcanP55066 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NcanP55066 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NcanP55066 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NcanP55066 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NcanP55066 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NcanP55066 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NcanP55066 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NcanP55066 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NcanP55066 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NcanP55066 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NcanP55066 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NcanP55066 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NcanP55066 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NcanP55066 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NcanP55066 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NcanP55066 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NcanP55066 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NcanP55066 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NcanP55066 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NcanP55066 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NcanP55066 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NcanP55066 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NcanP55066 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NcanP55066 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NcanP55066 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NcanP55066 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NcanP55066 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NcanP55066 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NcanP55066 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NcanP55066 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NcanP55066 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NcanP55066 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NcanP55066 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NcanP55066 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NcanP55066 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NcanP55066 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NcanP55066 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NcanP55066 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NcanP55066 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NcanP55066 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NcanP55066 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NcanP55066 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NcanP55066 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NcanP55066 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NcanP55066 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NcanP55066 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NcanP55066 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NcanP55066 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NcanP55066 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NcanP55066 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NcanP55066 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NcanP55066 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NcanP55066 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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