Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms