Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms