Protein–RNA interactions for Protein: P54130

Fgf9, Fibroblast growth factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf9P54130 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fgf9P54130 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fgf9P54130 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fgf9P54130 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Fgf9P54130 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fgf9P54130 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fgf9P54130 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fgf9P54130 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fgf9P54130 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Fgf9P54130 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fgf9P54130 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fgf9P54130 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fgf9P54130 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fgf9P54130 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fgf9P54130 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fgf9P54130 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fgf9P54130 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fgf9P54130 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fgf9P54130 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fgf9P54130 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fgf9P54130 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fgf9P54130 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fgf9P54130 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fgf9P54130 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fgf9P54130 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fgf9P54130 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fgf9P54130 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Fgf9P54130 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fgf9P54130 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fgf9P54130 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Fgf9P54130 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fgf9P54130 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fgf9P54130 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fgf9P54130 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fgf9P54130 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fgf9P54130 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fgf9P54130 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fgf9P54130 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fgf9P54130 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fgf9P54130 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fgf9P54130 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fgf9P54130 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Fgf9P54130 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fgf9P54130 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fgf9P54130 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fgf9P54130 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fgf9P54130 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fgf9P54130 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fgf9P54130 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fgf9P54130 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fgf9P54130 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fgf9P54130 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fgf9P54130 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fgf9P54130 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fgf9P54130 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fgf9P54130 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fgf9P54130 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fgf9P54130 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fgf9P54130 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fgf9P54130 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fgf9P54130 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fgf9P54130 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fgf9P54130 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fgf9P54130 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fgf9P54130 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fgf9P54130 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fgf9P54130 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fgf9P54130 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fgf9P54130 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fgf9P54130 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fgf9P54130 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fgf9P54130 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fgf9P54130 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fgf9P54130 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Fgf9P54130 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fgf9P54130 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fgf9P54130 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fgf9P54130 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fgf9P54130 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fgf9P54130 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fgf9P54130 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fgf9P54130 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fgf9P54130 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fgf9P54130 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fgf9P54130 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fgf9P54130 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fgf9P54130 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fgf9P54130 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fgf9P54130 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fgf9P54130 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fgf9P54130 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fgf9P54130 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fgf9P54130 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fgf9P54130 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fgf9P54130 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fgf9P54130 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fgf9P54130 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fgf9P54130 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fgf9P54130 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fgf9P54130 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms