Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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