Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa6P50704 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa6P50704 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa6P50704 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa6P50704 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa6P50704 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa6P50704 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa6P50704 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa6P50704 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa6P50704 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa6P50704 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms