Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TspoP50637 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TspoP50637 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
TspoP50637 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TspoP50637 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TspoP50637 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TspoP50637 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TspoP50637 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TspoP50637 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TspoP50637 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TspoP50637 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TspoP50637 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TspoP50637 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TspoP50637 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
TspoP50637 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TspoP50637 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TspoP50637 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TspoP50637 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TspoP50637 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TspoP50637 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TspoP50637 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TspoP50637 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TspoP50637 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TspoP50637 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TspoP50637 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
TspoP50637 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
TspoP50637 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
TspoP50637 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TspoP50637 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TspoP50637 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TspoP50637 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TspoP50637 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TspoP50637 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TspoP50637 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TspoP50637 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TspoP50637 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TspoP50637 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TspoP50637 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TspoP50637 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TspoP50637 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TspoP50637 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TspoP50637 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TspoP50637 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TspoP50637 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TspoP50637 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TspoP50637 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TspoP50637 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TspoP50637 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TspoP50637 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TspoP50637 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TspoP50637 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TspoP50637 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TspoP50637 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
TspoP50637 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TspoP50637 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TspoP50637 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TspoP50637 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TspoP50637 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TspoP50637 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TspoP50637 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TspoP50637 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TspoP50637 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
TspoP50637 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TspoP50637 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TspoP50637 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TspoP50637 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TspoP50637 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TspoP50637 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TspoP50637 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TspoP50637 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TspoP50637 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TspoP50637 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TspoP50637 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
TspoP50637 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
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TspoP50637 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TspoP50637 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TspoP50637 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
TspoP50637 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TspoP50637 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TspoP50637 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TspoP50637 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TspoP50637 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TspoP50637 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
TspoP50637 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
TspoP50637 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
TspoP50637 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TspoP50637 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TspoP50637 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
TspoP50637 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TspoP50637 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TspoP50637 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TspoP50637 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TspoP50637 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TspoP50637 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TspoP50637 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TspoP50637 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TspoP50637 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TspoP50637 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TspoP50637 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
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