Protein–RNA interactions for Protein: P47963

Rpl13, 60S ribosomal protein L13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13P47963 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms