Protein–RNA interactions for Protein: P47939

Resp18, Regulated endocrine-specific protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Resp18P47939 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Resp18P47939 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Resp18P47939 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Resp18P47939 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Resp18P47939 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Resp18P47939 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Resp18P47939 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Resp18P47939 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Resp18P47939 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Resp18P47939 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Resp18P47939 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Resp18P47939 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Resp18P47939 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Resp18P47939 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Resp18P47939 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Resp18P47939 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Resp18P47939 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Resp18P47939 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Resp18P47939 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Resp18P47939 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Resp18P47939 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Resp18P47939 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Resp18P47939 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms