Protein–RNA interactions for Protein: P47867

Scg3, Secretogranin-3, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg3P47867 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scg3P47867 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scg3P47867 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scg3P47867 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scg3P47867 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Scg3P47867 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scg3P47867 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scg3P47867 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scg3P47867 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scg3P47867 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scg3P47867 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scg3P47867 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scg3P47867 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scg3P47867 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scg3P47867 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scg3P47867 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scg3P47867 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scg3P47867 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scg3P47867 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scg3P47867 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scg3P47867 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scg3P47867 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Scg3P47867 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Scg3P47867 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scg3P47867 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Scg3P47867 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Scg3P47867 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Scg3P47867 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Scg3P47867 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Scg3P47867 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scg3P47867 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scg3P47867 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scg3P47867 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Scg3P47867 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scg3P47867 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scg3P47867 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scg3P47867 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Scg3P47867 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scg3P47867 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scg3P47867 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scg3P47867 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scg3P47867 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scg3P47867 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Scg3P47867 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scg3P47867 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scg3P47867 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Scg3P47867 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Scg3P47867 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scg3P47867 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scg3P47867 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scg3P47867 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scg3P47867 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scg3P47867 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scg3P47867 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Scg3P47867 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scg3P47867 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scg3P47867 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scg3P47867 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Scg3P47867 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scg3P47867 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Scg3P47867 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Scg3P47867 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Scg3P47867 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scg3P47867 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Scg3P47867 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Scg3P47867 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scg3P47867 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Scg3P47867 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Scg3P47867 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Scg3P47867 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scg3P47867 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Scg3P47867 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scg3P47867 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scg3P47867 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scg3P47867 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scg3P47867 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scg3P47867 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scg3P47867 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Scg3P47867 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scg3P47867 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scg3P47867 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scg3P47867 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Scg3P47867 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scg3P47867 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scg3P47867 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scg3P47867 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scg3P47867 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scg3P47867 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scg3P47867 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scg3P47867 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Scg3P47867 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scg3P47867 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scg3P47867 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scg3P47867 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scg3P47867 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scg3P47867 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scg3P47867 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scg3P47867 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scg3P47867 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scg3P47867 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms