Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SrprbP47758 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SrprbP47758 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrprbP47758 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrprbP47758 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SrprbP47758 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrprbP47758 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrprbP47758 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms