Protein–RNA interactions for Protein: P43345

Tlx1, T-cell leukemia homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx1P43345 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tlx1P43345 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tlx1P43345 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tlx1P43345 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tlx1P43345 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tlx1P43345 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tlx1P43345 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tlx1P43345 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tlx1P43345 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tlx1P43345 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tlx1P43345 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tlx1P43345 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlx1P43345 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlx1P43345 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlx1P43345 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlx1P43345 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlx1P43345 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlx1P43345 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlx1P43345 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlx1P43345 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlx1P43345 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlx1P43345 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlx1P43345 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlx1P43345 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlx1P43345 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlx1P43345 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlx1P43345 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlx1P43345 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlx1P43345 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlx1P43345 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlx1P43345 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlx1P43345 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlx1P43345 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlx1P43345 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlx1P43345 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlx1P43345 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlx1P43345 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlx1P43345 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlx1P43345 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlx1P43345 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlx1P43345 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlx1P43345 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlx1P43345 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlx1P43345 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlx1P43345 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlx1P43345 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlx1P43345 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlx1P43345 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlx1P43345 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlx1P43345 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlx1P43345 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlx1P43345 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlx1P43345 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlx1P43345 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlx1P43345 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlx1P43345 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlx1P43345 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlx1P43345 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlx1P43345 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlx1P43345 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlx1P43345 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlx1P43345 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlx1P43345 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlx1P43345 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlx1P43345 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlx1P43345 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlx1P43345 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlx1P43345 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlx1P43345 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlx1P43345 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlx1P43345 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlx1P43345 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlx1P43345 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlx1P43345 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlx1P43345 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlx1P43345 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlx1P43345 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlx1P43345 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlx1P43345 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlx1P43345 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlx1P43345 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlx1P43345 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlx1P43345 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlx1P43345 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlx1P43345 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlx1P43345 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlx1P43345 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlx1P43345 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlx1P43345 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlx1P43345 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlx1P43345 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlx1P43345 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlx1P43345 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlx1P43345 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlx1P43345 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlx1P43345 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlx1P43345 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlx1P43345 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlx1P43345 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlx1P43345 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms