Protein–RNA interactions for Protein: P43247

Msh2, DNA mismatch repair protein Msh2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh2P43247 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msh2P43247 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msh2P43247 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msh2P43247 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Msh2P43247 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Msh2P43247 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msh2P43247 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msh2P43247 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msh2P43247 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msh2P43247 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msh2P43247 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms