Protein–RNA interactions for Protein: P41778

Pbx1, Pre-B-cell leukemia transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbx1P41778 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pbx1P41778 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pbx1P41778 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pbx1P41778 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pbx1P41778 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pbx1P41778 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pbx1P41778 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pbx1P41778 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pbx1P41778 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pbx1P41778 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pbx1P41778 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pbx1P41778 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pbx1P41778 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pbx1P41778 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pbx1P41778 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pbx1P41778 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pbx1P41778 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pbx1P41778 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pbx1P41778 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pbx1P41778 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pbx1P41778 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pbx1P41778 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pbx1P41778 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pbx1P41778 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pbx1P41778 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pbx1P41778 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pbx1P41778 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pbx1P41778 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pbx1P41778 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pbx1P41778 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pbx1P41778 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pbx1P41778 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pbx1P41778 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pbx1P41778 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pbx1P41778 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pbx1P41778 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pbx1P41778 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pbx1P41778 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pbx1P41778 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pbx1P41778 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pbx1P41778 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pbx1P41778 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pbx1P41778 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pbx1P41778 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pbx1P41778 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pbx1P41778 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pbx1P41778 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pbx1P41778 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pbx1P41778 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pbx1P41778 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pbx1P41778 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pbx1P41778 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pbx1P41778 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pbx1P41778 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pbx1P41778 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pbx1P41778 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pbx1P41778 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pbx1P41778 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pbx1P41778 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pbx1P41778 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pbx1P41778 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pbx1P41778 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pbx1P41778 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pbx1P41778 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pbx1P41778 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pbx1P41778 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pbx1P41778 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pbx1P41778 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pbx1P41778 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pbx1P41778 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pbx1P41778 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pbx1P41778 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pbx1P41778 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pbx1P41778 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pbx1P41778 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pbx1P41778 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pbx1P41778 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pbx1P41778 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pbx1P41778 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pbx1P41778 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pbx1P41778 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pbx1P41778 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pbx1P41778 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pbx1P41778 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pbx1P41778 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pbx1P41778 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pbx1P41778 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pbx1P41778 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pbx1P41778 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pbx1P41778 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pbx1P41778 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pbx1P41778 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pbx1P41778 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pbx1P41778 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pbx1P41778 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pbx1P41778 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pbx1P41778 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pbx1P41778 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pbx1P41778 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pbx1P41778 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms