Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TfamP40630 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TfamP40630 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TfamP40630 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TfamP40630 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TfamP40630 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TfamP40630 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TfamP40630 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TfamP40630 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TfamP40630 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TfamP40630 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TfamP40630 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TfamP40630 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TfamP40630 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TfamP40630 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TfamP40630 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TfamP40630 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TfamP40630 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TfamP40630 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TfamP40630 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TfamP40630 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TfamP40630 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TfamP40630 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TfamP40630 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TfamP40630 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TfamP40630 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TfamP40630 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TfamP40630 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TfamP40630 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TfamP40630 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TfamP40630 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TfamP40630 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TfamP40630 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TfamP40630 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TfamP40630 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TfamP40630 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TfamP40630 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TfamP40630 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TfamP40630 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TfamP40630 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TfamP40630 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TfamP40630 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TfamP40630 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TfamP40630 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TfamP40630 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TfamP40630 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TfamP40630 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TfamP40630 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TfamP40630 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TfamP40630 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TfamP40630 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TfamP40630 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TfamP40630 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TfamP40630 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TfamP40630 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TfamP40630 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TfamP40630 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TfamP40630 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TfamP40630 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TfamP40630 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TfamP40630 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TfamP40630 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TfamP40630 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TfamP40630 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TfamP40630 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TfamP40630 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TfamP40630 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TfamP40630 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TfamP40630 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TfamP40630 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TfamP40630 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TfamP40630 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TfamP40630 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TfamP40630 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TfamP40630 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TfamP40630 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TfamP40630 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TfamP40630 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TfamP40630 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
TfamP40630 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
TfamP40630 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TfamP40630 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TfamP40630 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
TfamP40630 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TfamP40630 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TfamP40630 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TfamP40630 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TfamP40630 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TfamP40630 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TfamP40630 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
TfamP40630 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
TfamP40630 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TfamP40630 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TfamP40630 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TfamP40630 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TfamP40630 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TfamP40630 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TfamP40630 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TfamP40630 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TfamP40630 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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