Protein–RNA interactions for Protein: P40240

Cd9, CD9 antigen, mousemouse

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Length 226 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd9P40240 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd9P40240 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cd9P40240 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Cd9P40240 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd9P40240 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd9P40240 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd9P40240 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd9P40240 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd9P40240 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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