Protein–RNA interactions for Protein: P39749

Fen1, Flap endonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fen1P39749 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Fen1P39749 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fen1P39749 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fen1P39749 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fen1P39749 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fen1P39749 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fen1P39749 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fen1P39749 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fen1P39749 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fen1P39749 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fen1P39749 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fen1P39749 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fen1P39749 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fen1P39749 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fen1P39749 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fen1P39749 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fen1P39749 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fen1P39749 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fen1P39749 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fen1P39749 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fen1P39749 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fen1P39749 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fen1P39749 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fen1P39749 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fen1P39749 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fen1P39749 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fen1P39749 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fen1P39749 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fen1P39749 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fen1P39749 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fen1P39749 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fen1P39749 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fen1P39749 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Fen1P39749 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fen1P39749 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fen1P39749 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fen1P39749 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fen1P39749 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fen1P39749 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fen1P39749 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fen1P39749 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fen1P39749 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fen1P39749 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Fen1P39749 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Fen1P39749 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Fen1P39749 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fen1P39749 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fen1P39749 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fen1P39749 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fen1P39749 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Fen1P39749 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Fen1P39749 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fen1P39749 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fen1P39749 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fen1P39749 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fen1P39749 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fen1P39749 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fen1P39749 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Fen1P39749 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Fen1P39749 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fen1P39749 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Fen1P39749 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fen1P39749 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fen1P39749 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fen1P39749 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Fen1P39749 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fen1P39749 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fen1P39749 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fen1P39749 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fen1P39749 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fen1P39749 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fen1P39749 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fen1P39749 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fen1P39749 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fen1P39749 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fen1P39749 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fen1P39749 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fen1P39749 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fen1P39749 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fen1P39749 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fen1P39749 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fen1P39749 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fen1P39749 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fen1P39749 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Fen1P39749 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Fen1P39749 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fen1P39749 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fen1P39749 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fen1P39749 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fen1P39749 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fen1P39749 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fen1P39749 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fen1P39749 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Fen1P39749 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fen1P39749 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Fen1P39749 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fen1P39749 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Fen1P39749 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fen1P39749 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Fen1P39749 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms