Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TtlP38585 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TtlP38585 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TtlP38585 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TtlP38585 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TtlP38585 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TtlP38585 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TtlP38585 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TtlP38585 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TtlP38585 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TtlP38585 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TtlP38585 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TtlP38585 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TtlP38585 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TtlP38585 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TtlP38585 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TtlP38585 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TtlP38585 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TtlP38585 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TtlP38585 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
TtlP38585 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TtlP38585 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
TtlP38585 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TtlP38585 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TtlP38585 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TtlP38585 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TtlP38585 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TtlP38585 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TtlP38585 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TtlP38585 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TtlP38585 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TtlP38585 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TtlP38585 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TtlP38585 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TtlP38585 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TtlP38585 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TtlP38585 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TtlP38585 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TtlP38585 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TtlP38585 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TtlP38585 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TtlP38585 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TtlP38585 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TtlP38585 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TtlP38585 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TtlP38585 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TtlP38585 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
TtlP38585 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TtlP38585 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TtlP38585 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TtlP38585 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TtlP38585 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
TtlP38585 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TtlP38585 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TtlP38585 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TtlP38585 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TtlP38585 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TtlP38585 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TtlP38585 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TtlP38585 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
TtlP38585 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TtlP38585 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TtlP38585 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TtlP38585 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TtlP38585 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TtlP38585 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TtlP38585 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TtlP38585 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TtlP38585 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TtlP38585 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TtlP38585 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TtlP38585 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TtlP38585 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TtlP38585 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TtlP38585 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TtlP38585 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TtlP38585 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TtlP38585 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TtlP38585 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TtlP38585 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TtlP38585 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TtlP38585 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TtlP38585 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TtlP38585 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TtlP38585 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TtlP38585 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TtlP38585 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TtlP38585 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TtlP38585 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TtlP38585 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TtlP38585 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TtlP38585 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TtlP38585 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TtlP38585 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TtlP38585 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TtlP38585 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TtlP38585 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TtlP38585 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TtlP38585 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TtlP38585 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms