Protein–RNA interactions for Protein: P38060

Hmgcl, Hydroxymethylglutaryl-CoA lyase, mitochondrial, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgclP38060 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HmgclP38060 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HmgclP38060 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HmgclP38060 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HmgclP38060 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HmgclP38060 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HmgclP38060 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HmgclP38060 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HmgclP38060 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HmgclP38060 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HmgclP38060 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HmgclP38060 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HmgclP38060 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HmgclP38060 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HmgclP38060 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HmgclP38060 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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HmgclP38060 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HmgclP38060 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HmgclP38060 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HmgclP38060 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HmgclP38060 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HmgclP38060 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HmgclP38060 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HmgclP38060 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
HmgclP38060 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
HmgclP38060 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HmgclP38060 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HmgclP38060 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HmgclP38060 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HmgclP38060 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
HmgclP38060 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HmgclP38060 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HmgclP38060 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HmgclP38060 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HmgclP38060 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HmgclP38060 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HmgclP38060 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HmgclP38060 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HmgclP38060 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HmgclP38060 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HmgclP38060 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HmgclP38060 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HmgclP38060 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HmgclP38060 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HmgclP38060 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HmgclP38060 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HmgclP38060 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HmgclP38060 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HmgclP38060 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HmgclP38060 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HmgclP38060 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HmgclP38060 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HmgclP38060 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HmgclP38060 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HmgclP38060 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HmgclP38060 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HmgclP38060 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HmgclP38060 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HmgclP38060 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HmgclP38060 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HmgclP38060 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HmgclP38060 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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HmgclP38060 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HmgclP38060 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HmgclP38060 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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HmgclP38060 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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HmgclP38060 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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HmgclP38060 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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HmgclP38060 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HmgclP38060 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HmgclP38060 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HmgclP38060 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HmgclP38060 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HmgclP38060 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HmgclP38060 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HmgclP38060 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HmgclP38060 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HmgclP38060 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HmgclP38060 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HmgclP38060 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HmgclP38060 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HmgclP38060 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HmgclP38060 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HmgclP38060 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HmgclP38060 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HmgclP38060 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HmgclP38060 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HmgclP38060 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HmgclP38060 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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