Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms