Protein–RNA interactions for Protein: P35396

Ppard, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, mousemouse

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpardP35396 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PpardP35396 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PpardP35396 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PpardP35396 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PpardP35396 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PpardP35396 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PpardP35396 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PpardP35396 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PpardP35396 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PpardP35396 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PpardP35396 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PpardP35396 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PpardP35396 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PpardP35396 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PpardP35396 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PpardP35396 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PpardP35396 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PpardP35396 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PpardP35396 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PpardP35396 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PpardP35396 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PpardP35396 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PpardP35396 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PpardP35396 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PpardP35396 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PpardP35396 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PpardP35396 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PpardP35396 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PpardP35396 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PpardP35396 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PpardP35396 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PpardP35396 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PpardP35396 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PpardP35396 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PpardP35396 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PpardP35396 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PpardP35396 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PpardP35396 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PpardP35396 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PpardP35396 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PpardP35396 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PpardP35396 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PpardP35396 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PpardP35396 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PpardP35396 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PpardP35396 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PpardP35396 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PpardP35396 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PpardP35396 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PpardP35396 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PpardP35396 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PpardP35396 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PpardP35396 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PpardP35396 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PpardP35396 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PpardP35396 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PpardP35396 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PpardP35396 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PpardP35396 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PpardP35396 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PpardP35396 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PpardP35396 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PpardP35396 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PpardP35396 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PpardP35396 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PpardP35396 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PpardP35396 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PpardP35396 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PpardP35396 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PpardP35396 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PpardP35396 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PpardP35396 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PpardP35396 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PpardP35396 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PpardP35396 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PpardP35396 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PpardP35396 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PpardP35396 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PpardP35396 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PpardP35396 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PpardP35396 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PpardP35396 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PpardP35396 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PpardP35396 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PpardP35396 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PpardP35396 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PpardP35396 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PpardP35396 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PpardP35396 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PpardP35396 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PpardP35396 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PpardP35396 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PpardP35396 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PpardP35396 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PpardP35396 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PpardP35396 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PpardP35396 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PpardP35396 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PpardP35396 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PpardP35396 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms