Protein–RNA interactions for Protein: P35288

Rab23, Ras-related protein Rab-23, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab23P35288 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab23P35288 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab23P35288 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab23P35288 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab23P35288 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab23P35288 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab23P35288 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab23P35288 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab23P35288 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab23P35288 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab23P35288 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rab23P35288 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab23P35288 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab23P35288 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab23P35288 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab23P35288 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab23P35288 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab23P35288 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab23P35288 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab23P35288 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab23P35288 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab23P35288 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab23P35288 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab23P35288 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab23P35288 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab23P35288 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab23P35288 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab23P35288 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab23P35288 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab23P35288 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab23P35288 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab23P35288 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab23P35288 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab23P35288 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab23P35288 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab23P35288 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab23P35288 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab23P35288 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab23P35288 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab23P35288 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rab23P35288 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab23P35288 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rab23P35288 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rab23P35288 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab23P35288 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab23P35288 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab23P35288 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab23P35288 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab23P35288 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab23P35288 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab23P35288 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab23P35288 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab23P35288 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab23P35288 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab23P35288 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab23P35288 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab23P35288 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rab23P35288 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab23P35288 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab23P35288 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab23P35288 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab23P35288 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab23P35288 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab23P35288 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab23P35288 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab23P35288 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab23P35288 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab23P35288 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab23P35288 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab23P35288 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab23P35288 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab23P35288 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab23P35288 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab23P35288 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rab23P35288 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab23P35288 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab23P35288 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms