Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms