Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp4P35123 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp4P35123 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp4P35123 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp4P35123 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp4P35123 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp4P35123 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp4P35123 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp4P35123 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp4P35123 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp4P35123 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp4P35123 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp4P35123 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp4P35123 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp4P35123 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp4P35123 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp4P35123 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp4P35123 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp4P35123 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp4P35123 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp4P35123 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp4P35123 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp4P35123 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp4P35123 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp4P35123 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp4P35123 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp4P35123 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp4P35123 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp4P35123 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp4P35123 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp4P35123 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp4P35123 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp4P35123 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp4P35123 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp4P35123 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp4P35123 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp4P35123 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp4P35123 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp4P35123 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp4P35123 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp4P35123 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp4P35123 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp4P35123 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp4P35123 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp4P35123 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp4P35123 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp4P35123 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp4P35123 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp4P35123 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp4P35123 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp4P35123 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp4P35123 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp4P35123 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp4P35123 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp4P35123 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp4P35123 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms