Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms