Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms