Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cd28P31041 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cd28P31041 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cd28P31041 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cd28P31041 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cd28P31041 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cd28P31041 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cd28P31041 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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