Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

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Length 674 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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