Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RxrbP28704 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RxrbP28704 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RxrbP28704 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RxrbP28704 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RxrbP28704 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RxrbP28704 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RxrbP28704 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RxrbP28704 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RxrbP28704 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RxrbP28704 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RxrbP28704 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RxrbP28704 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RxrbP28704 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RxrbP28704 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RxrbP28704 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RxrbP28704 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RxrbP28704 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RxrbP28704 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RxrbP28704 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RxrbP28704 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RxrbP28704 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RxrbP28704 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RxrbP28704 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RxrbP28704 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RxrbP28704 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RxrbP28704 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RxrbP28704 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RxrbP28704 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RxrbP28704 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RxrbP28704 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RxrbP28704 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RxrbP28704 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RxrbP28704 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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RxrbP28704 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RxrbP28704 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RxrbP28704 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RxrbP28704 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RxrbP28704 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RxrbP28704 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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