Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RxraP28700 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RxraP28700 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RxraP28700 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RxraP28700 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RxraP28700 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
RxraP28700 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RxraP28700 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RxraP28700 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RxraP28700 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RxraP28700 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RxraP28700 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RxraP28700 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RxraP28700 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RxraP28700 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RxraP28700 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RxraP28700 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RxraP28700 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RxraP28700 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RxraP28700 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RxraP28700 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RxraP28700 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RxraP28700 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RxraP28700 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RxraP28700 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RxraP28700 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RxraP28700 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RxraP28700 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RxraP28700 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RxraP28700 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RxraP28700 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RxraP28700 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RxraP28700 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RxraP28700 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RxraP28700 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RxraP28700 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RxraP28700 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RxraP28700 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RxraP28700 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RxraP28700 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RxraP28700 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RxraP28700 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RxraP28700 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RxraP28700 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RxraP28700 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RxraP28700 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RxraP28700 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RxraP28700 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RxraP28700 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RxraP28700 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RxraP28700 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RxraP28700 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RxraP28700 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RxraP28700 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RxraP28700 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RxraP28700 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RxraP28700 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RxraP28700 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RxraP28700 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RxraP28700 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
RxraP28700 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RxraP28700 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RxraP28700 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RxraP28700 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RxraP28700 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RxraP28700 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RxraP28700 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RxraP28700 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RxraP28700 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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RxraP28700 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RxraP28700 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RxraP28700 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RxraP28700 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RxraP28700 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RxraP28700 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RxraP28700 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RxraP28700 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RxraP28700 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RxraP28700 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RxraP28700 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RxraP28700 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RxraP28700 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RxraP28700 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RxraP28700 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RxraP28700 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RxraP28700 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RxraP28700 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RxraP28700 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RxraP28700 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RxraP28700 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RxraP28700 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RxraP28700 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RxraP28700 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RxraP28700 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RxraP28700 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RxraP28700 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RxraP28700 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RxraP28700 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RxraP28700 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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