Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa2P28309 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa2P28309 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa2P28309 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa2P28309 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa2P28309 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa2P28309 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa2P28309 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms