Protein–RNA interactions for Protein: P28028

Braf, Serine/threonine-protein kinase B-raf, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrafP28028 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
BrafP28028 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
BrafP28028 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BrafP28028 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
BrafP28028 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BrafP28028 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BrafP28028 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BrafP28028 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BrafP28028 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BrafP28028 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BrafP28028 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BrafP28028 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BrafP28028 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BrafP28028 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
BrafP28028 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BrafP28028 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BrafP28028 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BrafP28028 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BrafP28028 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BrafP28028 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
BrafP28028 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BrafP28028 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BrafP28028 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BrafP28028 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BrafP28028 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BrafP28028 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
BrafP28028 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BrafP28028 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BrafP28028 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
BrafP28028 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BrafP28028 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BrafP28028 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BrafP28028 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BrafP28028 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BrafP28028 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BrafP28028 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BrafP28028 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BrafP28028 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BrafP28028 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BrafP28028 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BrafP28028 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BrafP28028 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BrafP28028 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BrafP28028 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BrafP28028 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BrafP28028 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BrafP28028 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BrafP28028 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BrafP28028 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BrafP28028 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BrafP28028 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BrafP28028 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BrafP28028 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BrafP28028 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BrafP28028 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BrafP28028 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BrafP28028 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BrafP28028 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BrafP28028 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BrafP28028 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BrafP28028 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BrafP28028 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BrafP28028 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BrafP28028 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BrafP28028 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BrafP28028 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BrafP28028 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BrafP28028 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BrafP28028 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BrafP28028 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BrafP28028 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BrafP28028 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BrafP28028 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BrafP28028 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BrafP28028 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BrafP28028 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BrafP28028 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BrafP28028 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
BrafP28028 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BrafP28028 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BrafP28028 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BrafP28028 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BrafP28028 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BrafP28028 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BrafP28028 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
BrafP28028 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
BrafP28028 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BrafP28028 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BrafP28028 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BrafP28028 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BrafP28028 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BrafP28028 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
BrafP28028 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BrafP28028 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BrafP28028 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BrafP28028 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
BrafP28028 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BrafP28028 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BrafP28028 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BrafP28028 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms