Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2afxP27661 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2afxP27661 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2afxP27661 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2afxP27661 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2afxP27661 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2afxP27661 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2afxP27661 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2afxP27661 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2afxP27661 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
H2afxP27661 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2afxP27661 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2afxP27661 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
H2afxP27661 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
H2afxP27661 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2afxP27661 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2afxP27661 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2afxP27661 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2afxP27661 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2afxP27661 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2afxP27661 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2afxP27661 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2afxP27661 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2afxP27661 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2afxP27661 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2afxP27661 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2afxP27661 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afxP27661 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afxP27661 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afxP27661 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afxP27661 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afxP27661 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afxP27661 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afxP27661 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afxP27661 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afxP27661 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afxP27661 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afxP27661 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afxP27661 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afxP27661 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afxP27661 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afxP27661 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afxP27661 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afxP27661 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afxP27661 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afxP27661 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afxP27661 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afxP27661 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afxP27661 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afxP27661 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afxP27661 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afxP27661 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afxP27661 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afxP27661 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afxP27661 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afxP27661 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afxP27661 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afxP27661 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afxP27661 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afxP27661 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afxP27661 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afxP27661 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afxP27661 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afxP27661 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afxP27661 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afxP27661 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afxP27661 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afxP27661 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afxP27661 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afxP27661 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afxP27661 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afxP27661 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afxP27661 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afxP27661 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afxP27661 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afxP27661 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afxP27661 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afxP27661 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afxP27661 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afxP27661 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afxP27661 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afxP27661 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afxP27661 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afxP27661 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afxP27661 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afxP27661 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afxP27661 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afxP27661 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afxP27661 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afxP27661 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afxP27661 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afxP27661 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afxP27661 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afxP27661 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afxP27661 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afxP27661 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afxP27661 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afxP27661 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afxP27661 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afxP27661 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms