Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ChgaP26339 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ChgaP26339 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ChgaP26339 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ChgaP26339 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ChgaP26339 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ChgaP26339 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ChgaP26339 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ChgaP26339 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ChgaP26339 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ChgaP26339 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ChgaP26339 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ChgaP26339 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms