Protein–RNA interactions for Protein: P23607

Zfa, Zinc finger autosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfaP23607 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZfaP23607 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZfaP23607 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZfaP23607 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZfaP23607 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZfaP23607 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZfaP23607 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms