Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms