Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ggta1P23336 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ggta1P23336 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Ggta1P23336 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Ggta1P23336 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Ggta1P23336 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Ggta1P23336 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Ggta1P23336 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Ggta1P23336 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Ggta1P23336 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Ggta1P23336 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Ggta1P23336 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ggta1P23336 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ggta1P23336 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Ggta1P23336 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ggta1P23336 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ggta1P23336 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ggta1P23336 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ggta1P23336 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ggta1P23336 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ggta1P23336 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ggta1P23336 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ggta1P23336 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ggta1P23336 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ggta1P23336 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ggta1P23336 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ggta1P23336 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Ggta1P23336 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms