Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms