Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ntf3P20181 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ntf3P20181 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ntf3P20181 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ntf3P20181 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ntf3P20181 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ntf3P20181 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ntf3P20181 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ntf3P20181 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ntf3P20181 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ntf3P20181 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ntf3P20181 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ntf3P20181 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ntf3P20181 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ntf3P20181 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ntf3P20181 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ntf3P20181 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ntf3P20181 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ntf3P20181 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ntf3P20181 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ntf3P20181 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ntf3P20181 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ntf3P20181 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ntf3P20181 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ntf3P20181 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ntf3P20181 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ntf3P20181 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ntf3P20181 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ntf3P20181 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ntf3P20181 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ntf3P20181 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ntf3P20181 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ntf3P20181 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ntf3P20181 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ntf3P20181 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ntf3P20181 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ntf3P20181 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ntf3P20181 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ntf3P20181 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ntf3P20181 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ntf3P20181 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ntf3P20181 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ntf3P20181 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ntf3P20181 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ntf3P20181 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ntf3P20181 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms