Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms