Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms