Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rag1P15919 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rag1P15919 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rag1P15919 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rag1P15919 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rag1P15919 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rag1P15919 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rag1P15919 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rag1P15919 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rag1P15919 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms