Protein–RNA interactions for Protein: P15331

Prph, Peripherin, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrphP15331 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrphP15331 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrphP15331 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrphP15331 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrphP15331 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrphP15331 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrphP15331 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrphP15331 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrphP15331 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrphP15331 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrphP15331 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrphP15331 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrphP15331 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PrphP15331 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrphP15331 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrphP15331 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrphP15331 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrphP15331 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrphP15331 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrphP15331 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrphP15331 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrphP15331 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrphP15331 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrphP15331 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PrphP15331 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrphP15331 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrphP15331 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrphP15331 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrphP15331 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrphP15331 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrphP15331 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrphP15331 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrphP15331 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrphP15331 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrphP15331 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrphP15331 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrphP15331 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrphP15331 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrphP15331 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrphP15331 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrphP15331 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrphP15331 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrphP15331 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrphP15331 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrphP15331 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrphP15331 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrphP15331 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrphP15331 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrphP15331 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrphP15331 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrphP15331 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrphP15331 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrphP15331 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrphP15331 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PrphP15331 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PrphP15331 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrphP15331 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrphP15331 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrphP15331 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PrphP15331 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrphP15331 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrphP15331 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrphP15331 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PrphP15331 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrphP15331 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrphP15331 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrphP15331 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrphP15331 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrphP15331 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrphP15331 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrphP15331 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrphP15331 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrphP15331 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrphP15331 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrphP15331 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrphP15331 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrphP15331 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrphP15331 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrphP15331 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrphP15331 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PrphP15331 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PrphP15331 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PrphP15331 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrphP15331 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrphP15331 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrphP15331 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrphP15331 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrphP15331 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrphP15331 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrphP15331 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrphP15331 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrphP15331 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrphP15331 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrphP15331 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrphP15331 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrphP15331 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrphP15331 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrphP15331 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrphP15331 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrphP15331 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms