Protein–RNA interactions for Protein: P13864

Dnmt1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt1P13864 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dnmt1P13864 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dnmt1P13864 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dnmt1P13864 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dnmt1P13864 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dnmt1P13864 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dnmt1P13864 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dnmt1P13864 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dnmt1P13864 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dnmt1P13864 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Dnmt1P13864 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dnmt1P13864 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dnmt1P13864 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Dnmt1P13864 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dnmt1P13864 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dnmt1P13864 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dnmt1P13864 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dnmt1P13864 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dnmt1P13864 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dnmt1P13864 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dnmt1P13864 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dnmt1P13864 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dnmt1P13864 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dnmt1P13864 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dnmt1P13864 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dnmt1P13864 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dnmt1P13864 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Dnmt1P13864 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dnmt1P13864 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Dnmt1P13864 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dnmt1P13864 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dnmt1P13864 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dnmt1P13864 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Dnmt1P13864 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Dnmt1P13864 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Dnmt1P13864 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Dnmt1P13864 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Dnmt1P13864 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dnmt1P13864 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dnmt1P13864 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dnmt1P13864 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dnmt1P13864 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dnmt1P13864 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dnmt1P13864 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dnmt1P13864 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Dnmt1P13864 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dnmt1P13864 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dnmt1P13864 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dnmt1P13864 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dnmt1P13864 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dnmt1P13864 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dnmt1P13864 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dnmt1P13864 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Dnmt1P13864 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dnmt1P13864 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Dnmt1P13864 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dnmt1P13864 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dnmt1P13864 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Dnmt1P13864 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dnmt1P13864 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dnmt1P13864 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dnmt1P13864 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dnmt1P13864 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dnmt1P13864 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dnmt1P13864 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dnmt1P13864 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dnmt1P13864 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dnmt1P13864 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Dnmt1P13864 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dnmt1P13864 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Dnmt1P13864 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Dnmt1P13864 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dnmt1P13864 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dnmt1P13864 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dnmt1P13864 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dnmt1P13864 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dnmt1P13864 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dnmt1P13864 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dnmt1P13864 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dnmt1P13864 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dnmt1P13864 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dnmt1P13864 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dnmt1P13864 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dnmt1P13864 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dnmt1P13864 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dnmt1P13864 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dnmt1P13864 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dnmt1P13864 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dnmt1P13864 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dnmt1P13864 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dnmt1P13864 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dnmt1P13864 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dnmt1P13864 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dnmt1P13864 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dnmt1P13864 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Dnmt1P13864 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dnmt1P13864 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dnmt1P13864 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dnmt1P13864 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dnmt1P13864 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms