Protein–RNA interactions for Protein: P13609

Srgn, Serglycin, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrgnP13609 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrgnP13609 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrgnP13609 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrgnP13609 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrgnP13609 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrgnP13609 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrgnP13609 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrgnP13609 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrgnP13609 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrgnP13609 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrgnP13609 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrgnP13609 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrgnP13609 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrgnP13609 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrgnP13609 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrgnP13609 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SrgnP13609 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrgnP13609 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrgnP13609 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrgnP13609 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrgnP13609 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrgnP13609 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrgnP13609 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrgnP13609 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrgnP13609 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrgnP13609 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrgnP13609 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SrgnP13609 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrgnP13609 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrgnP13609 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrgnP13609 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrgnP13609 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrgnP13609 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrgnP13609 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrgnP13609 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrgnP13609 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrgnP13609 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrgnP13609 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrgnP13609 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrgnP13609 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrgnP13609 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SrgnP13609 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrgnP13609 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrgnP13609 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrgnP13609 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SrgnP13609 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SrgnP13609 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrgnP13609 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SrgnP13609 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrgnP13609 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrgnP13609 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrgnP13609 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrgnP13609 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrgnP13609 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrgnP13609 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrgnP13609 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrgnP13609 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrgnP13609 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrgnP13609 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrgnP13609 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms