Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms