Protein–RNA interactions for Protein: P12970

Rpl7a, 60S ribosomal protein L7a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl7aP12970 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl7aP12970 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl7aP12970 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl7aP12970 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl7aP12970 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl7aP12970 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl7aP12970 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl7aP12970 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl7aP12970 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl7aP12970 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl7aP12970 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl7aP12970 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl7aP12970 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl7aP12970 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl7aP12970 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl7aP12970 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl7aP12970 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl7aP12970 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl7aP12970 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl7aP12970 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl7aP12970 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl7aP12970 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl7aP12970 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl7aP12970 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl7aP12970 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl7aP12970 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl7aP12970 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl7aP12970 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl7aP12970 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl7aP12970 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl7aP12970 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl7aP12970 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl7aP12970 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl7aP12970 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl7aP12970 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl7aP12970 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl7aP12970 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl7aP12970 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl7aP12970 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl7aP12970 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl7aP12970 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl7aP12970 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl7aP12970 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl7aP12970 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl7aP12970 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl7aP12970 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl7aP12970 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl7aP12970 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl7aP12970 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl7aP12970 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl7aP12970 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl7aP12970 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl7aP12970 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpl7aP12970 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpl7aP12970 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpl7aP12970 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpl7aP12970 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpl7aP12970 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpl7aP12970 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl7aP12970 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl7aP12970 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl7aP12970 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl7aP12970 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl7aP12970 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl7aP12970 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl7aP12970 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl7aP12970 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl7aP12970 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl7aP12970 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl7aP12970 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl7aP12970 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl7aP12970 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl7aP12970 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl7aP12970 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl7aP12970 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl7aP12970 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl7aP12970 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl7aP12970 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl7aP12970 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl7aP12970 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl7aP12970 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl7aP12970 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl7aP12970 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl7aP12970 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl7aP12970 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl7aP12970 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl7aP12970 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl7aP12970 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl7aP12970 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl7aP12970 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl7aP12970 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl7aP12970 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl7aP12970 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl7aP12970 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl7aP12970 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl7aP12970 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl7aP12970 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl7aP12970 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl7aP12970 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl7aP12970 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms