Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Calb1P12658 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Calb1P12658 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Calb1P12658 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Calb1P12658 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Calb1P12658 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms