Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa1P11477 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa1P11477 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa1P11477 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa1P11477 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa1P11477 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa1P11477 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa1P11477 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa1P11477 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa1P11477 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa1P11477 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms