Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Mpv17l-202ENSMUST00000124947 768 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Gm37073-201ENSMUST00000192469 1222 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Gm9520-201ENSMUST00000209460 1253 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Gm19395-201ENSMUST00000219618 646 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Defb30-202ENSMUST00000111207 989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Gm24380-201ENSMUST00000122696 324 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Vmn1r-ps8-201ENSMUST00000177200 838 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Gm3476-203ENSMUST00000190582 612 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Gm8679-201ENSMUST00000210651 1036 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Tpt1-ps4-201ENSMUST00000210908 503 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Vmn1r3-201ENSMUST00000105159 1011 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Gm649-201ENSMUST00000117284 1054 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Gm14659-201ENSMUST00000117667 843 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Gm45610-201ENSMUST00000209227 784 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 CT009711.2-202ENSMUST00000224538 973 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 CT009713.1-201ENSMUST00000224828 853 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Hprt-201ENSMUST00000026723 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms